Гимназия №5 входит в состав ассоциации Школ Skolkovo и имеет статус Экспериментальной площадки Федерального института развития образования при Министерстве образования РФ по направлению «разработка, апробация и (или) внедрение новых элементов содержания образования и систем воспитания, новых педагогических технологий, учебно-методических и учебно-лабораторных комплексов, форм, методов и средств обучения в организациях, осуществляющих образовательную деятельность, в том числе ресурсов негосударственного сектора» на 2016-2020 годы.

Проект «Я. Другие. Мир» - МАОУ «Гимназия № 5» г.Чебоксары стала победителем в номинации ШКОЛА — ЦЕНТР СОЦИУМА во Всероссийском конкурсе ТОП Школа «Рыбаков Фонда». С 2019 года с открытием нового корпуса Т (1-11классы, 2167 учеников) реализует инклюзивное образование для более 40 учеников с особыми образовательными потребностями, в т.ч. и для детей с РАС.

Гимназия реализует практики тьюторского сопровождения в индивидуальных образовательных программах в старшей школе, а также в области развития познавательной деятельности и в предмете основной школы. Данные практики и технологии сертифицированы (с 2012 года) межрегиональной тьюторской ассоциацией (МТА) под руководством президента Т.М. Ковалевой.

Также гимназия реализует практики и технологии в рамках ФГОС основной и старшей школы с 2010 года.